Cómo calcular una puntuación LOD

by admin 06/06/2011

Cómo calcular una puntuación LOD

Mapeo genético se utiliza para asignar la posición de los genes y otras características en un genoma. Acoplamiento genético ocurre cuando los alelos pares de genes se heredan juntos. La cuenta de LOD se utiliza en animales, plantas y las poblaciones humanas para determinar la relación entre dos características o entre un rasgo y un marcador. La puntuación LOD proporciona una medida de la probabilidad que los genes están ligados y si los dos marcadores que se analizan en el mismo cromosoma.

Instrucciones

• Establecer un pedigree familiar y hacer un número de estimaciones de frecuencia de recombinación o la medida de la distancia entre los dos genes.

• Calcular la cuenta de LOD para cada una de las estimaciones utilizando la siguiente fórmula:

Puntuación LOD = Log10 (probabilidad de la secuencia del nacimiento con un acoplamiento dado /

probability of birth sequence with no linkage)

• Evaluar si hay relación entre los dos genes mediante el análisis de las cuentas del LOD. Una probabilidad de ligamiento de genes se establece si la cuenta de LOD es mayor que 3. Acoplamiento del gene está excluida si la puntuación LOD es menos de -2.

Consejos y advertencias

  • Frecuencias de recombinación de pares distintos de genes se pueden utilizar para crear un mapa de gen.
  • Algunos genes pueden heredarse juntos si se encuentran en el mismo cromosoma.

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